WHM(Web Hosting Manager) isimli ana yönetim yazılımı cPanel ile birlikte yüklenmektedir. WHM üzerinden oluşturulan hesaplar client hesap olarak adlandırılır. Client hesaplar cPanel üzerinden yönetilebilir.

WHM üzerinden bayi hesapları açılabilir, kullanıcı hesabı açılabilir, hesaplar düzenlenebilir, kota bilgileri girilebilir, hesaplar kapatılabilir, hesaba bağlı sitelerin ayarları düzenlenebilir ve cPanel ayarları yapılabilir.